La réforme du DES d'hépato-gastro-entérologue, qui doit entrer en application en novembre de cette année, prévoit une formation découpée en trois phases : une phase socle et une phase d'approfondissement sanctionnées par la soutenance de la thèse de docteur en médecine et d'une durée variable selon les spécialités, suivies d'une phase de mise en responsabilité sanctionnée par la soutenance du mémoire de DES, durant laquelle les internes passent du statut d'étudiant à celui d'assistant spécialiste de 3ème cycle et sont placés en « autonomie supervisée ».
Alors que cette formation devait durer 6 ans, la réforme propose de la réduire à 4 ans, d'où le mécontement des médecins des différents C.H.U. de France dont ceux de Nantes, comme l'explique Ouest-France du 1er et 2 avril 2017.