L'Imad assure la prise en charge des maladies digestives du nouveau né et de l'enfant au sein des services de pédiatrie et de chirurgie infantile (Pôle mère-enfant, CHU de Nantes) afin de corriger les malformations congénitales, de mettre en place des assistances nutritionnelles, de traiter les maladies inflammatoires de l'enfant et de prendre en charge les troubles sphinctériens.
Le lien fort entre le Pôle clinique adulte et le Pôle mère-enfant a permis de constituer, en partenariat avec l'hôpital Necker de Paris, un centre national de maladies rares consacré aux malformations anorectales et pelviennes (MAREP).
L'IMAD centre de référence des malformations ano-rectales et pelviennes (MAREP)